Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms