Protein–RNA interactions for Protein: P42126

ECI1, Enoyl-CoA delta isomerase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECI1P42126 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ECI1P42126 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ECI1P42126 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ECI1P42126 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ECI1P42126 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ECI1P42126 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ECI1P42126 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ECI1P42126 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ECI1P42126 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ECI1P42126 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ECI1P42126 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ECI1P42126 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ECI1P42126 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ECI1P42126 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ECI1P42126 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ECI1P42126 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ECI1P42126 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ECI1P42126 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ECI1P42126 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ECI1P42126 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ECI1P42126 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ECI1P42126 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ECI1P42126 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECI1P42126 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECI1P42126 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECI1P42126 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ECI1P42126 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECI1P42126 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ECI1P42126 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECI1P42126 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECI1P42126 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECI1P42126 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECI1P42126 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECI1P42126 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECI1P42126 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECI1P42126 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECI1P42126 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECI1P42126 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ECI1P42126 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ECI1P42126 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ECI1P42126 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECI1P42126 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECI1P42126 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECI1P42126 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECI1P42126 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ECI1P42126 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECI1P42126 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECI1P42126 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ECI1P42126 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECI1P42126 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECI1P42126 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ECI1P42126 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECI1P42126 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECI1P42126 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECI1P42126 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECI1P42126 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECI1P42126 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECI1P42126 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECI1P42126 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ECI1P42126 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECI1P42126 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECI1P42126 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECI1P42126 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ECI1P42126 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECI1P42126 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECI1P42126 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECI1P42126 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ECI1P42126 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECI1P42126 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECI1P42126 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECI1P42126 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECI1P42126 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECI1P42126 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECI1P42126 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECI1P42126 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECI1P42126 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECI1P42126 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECI1P42126 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECI1P42126 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECI1P42126 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECI1P42126 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECI1P42126 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECI1P42126 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ECI1P42126 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECI1P42126 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ECI1P42126 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECI1P42126 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECI1P42126 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECI1P42126 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECI1P42126 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECI1P42126 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECI1P42126 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECI1P42126 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECI1P42126 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECI1P42126 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECI1P42126 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECI1P42126 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECI1P42126 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECI1P42126 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ECI1P42126 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms