Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARL1P40616 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARL1P40616 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARL1P40616 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARL1P40616 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARL1P40616 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ARL1P40616 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARL1P40616 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARL1P40616 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARL1P40616 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARL1P40616 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARL1P40616 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARL1P40616 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARL1P40616 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARL1P40616 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARL1P40616 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARL1P40616 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARL1P40616 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARL1P40616 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARL1P40616 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARL1P40616 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARL1P40616 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARL1P40616 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARL1P40616 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARL1P40616 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARL1P40616 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARL1P40616 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARL1P40616 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARL1P40616 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARL1P40616 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARL1P40616 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARL1P40616 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARL1P40616 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARL1P40616 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARL1P40616 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARL1P40616 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARL1P40616 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARL1P40616 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARL1P40616 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARL1P40616 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARL1P40616 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARL1P40616 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARL1P40616 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ARL1P40616 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARL1P40616 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARL1P40616 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ARL1P40616 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARL1P40616 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ARL1P40616 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ARL1P40616 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARL1P40616 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARL1P40616 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARL1P40616 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARL1P40616 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARL1P40616 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARL1P40616 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARL1P40616 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARL1P40616 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARL1P40616 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARL1P40616 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARL1P40616 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARL1P40616 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARL1P40616 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARL1P40616 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARL1P40616 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARL1P40616 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARL1P40616 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARL1P40616 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARL1P40616 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARL1P40616 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARL1P40616 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARL1P40616 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARL1P40616 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARL1P40616 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARL1P40616 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARL1P40616 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARL1P40616 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARL1P40616 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARL1P40616 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARL1P40616 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARL1P40616 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARL1P40616 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARL1P40616 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ARL1P40616 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ARL1P40616 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ARL1P40616 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ARL1P40616 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ARL1P40616 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ARL1P40616 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ARL1P40616 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ARL1P40616 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
ARL1P40616 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ARL1P40616 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ARL1P40616 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ARL1P40616 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ARL1P40616 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ARL1P40616 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ARL1P40616 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ARL1P40616 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARL1P40616 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms