Protein–RNA interactions for Protein: P35916

FLT4, Vascular endothelial growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT4P35916 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FLT4P35916 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FLT4P35916 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FLT4P35916 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
FLT4P35916 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FLT4P35916 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FLT4P35916 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FLT4P35916 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FLT4P35916 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FLT4P35916 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FLT4P35916 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FLT4P35916 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FLT4P35916 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FLT4P35916 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FLT4P35916 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
FLT4P35916 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
FLT4P35916 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
FLT4P35916 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
FLT4P35916 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.39
FLT4P35916 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FLT4P35916 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FLT4P35916 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FLT4P35916 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FLT4P35916 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FLT4P35916 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FLT4P35916 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FLT4P35916 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FLT4P35916 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FLT4P35916 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FLT4P35916 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FLT4P35916 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FLT4P35916 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FLT4P35916 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FLT4P35916 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FLT4P35916 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FLT4P35916 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FLT4P35916 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FLT4P35916 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FLT4P35916 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
FLT4P35916 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
FLT4P35916 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FLT4P35916 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FLT4P35916 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FLT4P35916 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FLT4P35916 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
FLT4P35916 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
FLT4P35916 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FLT4P35916 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FLT4P35916 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FLT4P35916 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FLT4P35916 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FLT4P35916 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FLT4P35916 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FLT4P35916 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FLT4P35916 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FLT4P35916 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FLT4P35916 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FLT4P35916 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FLT4P35916 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
FLT4P35916 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FLT4P35916 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
FLT4P35916 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FLT4P35916 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FLT4P35916 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FLT4P35916 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FLT4P35916 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FLT4P35916 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FLT4P35916 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FLT4P35916 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FLT4P35916 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
FLT4P35916 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FLT4P35916 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FLT4P35916 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
FLT4P35916 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FLT4P35916 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FLT4P35916 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
FLT4P35916 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FLT4P35916 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FLT4P35916 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FLT4P35916 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FLT4P35916 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FLT4P35916 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FLT4P35916 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FLT4P35916 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FLT4P35916 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FLT4P35916 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FLT4P35916 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FLT4P35916 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FLT4P35916 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FLT4P35916 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FLT4P35916 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FLT4P35916 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FLT4P35916 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FLT4P35916 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FLT4P35916 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FLT4P35916 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FLT4P35916 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FLT4P35916 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FLT4P35916 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FLT4P35916 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms