Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SFTPDP35247 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFTPDP35247 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms