Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPA3P35244 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPA3P35244 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RPA3P35244 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPA3P35244 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RPA3P35244 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPA3P35244 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RPA3P35244 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPA3P35244 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPA3P35244 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPA3P35244 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPA3P35244 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPA3P35244 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPA3P35244 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPA3P35244 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPA3P35244 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPA3P35244 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPA3P35244 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPA3P35244 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RPA3P35244 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPA3P35244 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPA3P35244 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPA3P35244 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPA3P35244 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RPA3P35244 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPA3P35244 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPA3P35244 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPA3P35244 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPA3P35244 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPA3P35244 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPA3P35244 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPA3P35244 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPA3P35244 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPA3P35244 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPA3P35244 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPA3P35244 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPA3P35244 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPA3P35244 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPA3P35244 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPA3P35244 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPA3P35244 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RPA3P35244 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPA3P35244 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RPA3P35244 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RPA3P35244 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPA3P35244 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPA3P35244 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPA3P35244 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPA3P35244 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPA3P35244 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPA3P35244 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPA3P35244 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPA3P35244 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPA3P35244 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPA3P35244 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPA3P35244 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPA3P35244 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPA3P35244 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPA3P35244 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPA3P35244 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPA3P35244 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPA3P35244 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPA3P35244 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPA3P35244 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPA3P35244 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPA3P35244 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RPA3P35244 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPA3P35244 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RPA3P35244 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPA3P35244 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPA3P35244 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPA3P35244 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPA3P35244 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPA3P35244 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPA3P35244 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPA3P35244 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPA3P35244 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPA3P35244 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPA3P35244 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPA3P35244 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPA3P35244 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RPA3P35244 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RPA3P35244 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPA3P35244 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPA3P35244 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPA3P35244 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPA3P35244 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPA3P35244 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPA3P35244 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPA3P35244 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPA3P35244 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPA3P35244 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPA3P35244 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPA3P35244 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPA3P35244 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RPA3P35244 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPA3P35244 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPA3P35244 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RPA3P35244 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPA3P35244 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms