Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
HOXA13P31271 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms