Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms