Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CRABP1P29762 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms