Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD34P28906 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD34P28906 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD34P28906 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD34P28906 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD34P28906 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD34P28906 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD34P28906 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD34P28906 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD34P28906 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD34P28906 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD34P28906 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD34P28906 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD34P28906 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD34P28906 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD34P28906 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD34P28906 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD34P28906 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CD34P28906 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD34P28906 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD34P28906 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD34P28906 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD34P28906 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD34P28906 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CD34P28906 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD34P28906 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD34P28906 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD34P28906 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD34P28906 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD34P28906 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD34P28906 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD34P28906 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD34P28906 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD34P28906 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD34P28906 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD34P28906 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD34P28906 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD34P28906 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD34P28906 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD34P28906 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD34P28906 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD34P28906 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD34P28906 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD34P28906 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD34P28906 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD34P28906 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD34P28906 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD34P28906 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD34P28906 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD34P28906 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD34P28906 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD34P28906 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD34P28906 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD34P28906 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD34P28906 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CD34P28906 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD34P28906 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD34P28906 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CD34P28906 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD34P28906 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD34P28906 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD34P28906 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD34P28906 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD34P28906 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD34P28906 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD34P28906 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD34P28906 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD34P28906 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD34P28906 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD34P28906 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD34P28906 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD34P28906 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD34P28906 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD34P28906 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD34P28906 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD34P28906 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD34P28906 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD34P28906 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD34P28906 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD34P28906 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD34P28906 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD34P28906 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD34P28906 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD34P28906 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD34P28906 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD34P28906 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD34P28906 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD34P28906 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD34P28906 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD34P28906 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD34P28906 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD34P28906 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD34P28906 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD34P28906 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD34P28906 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD34P28906 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD34P28906 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CD34P28906 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD34P28906 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD34P28906 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms