Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCAP28676 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCAP28676 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCAP28676 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GCAP28676 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GCAP28676 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GCAP28676 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GCAP28676 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCAP28676 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCAP28676 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCAP28676 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCAP28676 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCAP28676 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCAP28676 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCAP28676 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCAP28676 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCAP28676 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCAP28676 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCAP28676 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCAP28676 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCAP28676 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GCAP28676 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCAP28676 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCAP28676 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GCAP28676 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCAP28676 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCAP28676 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCAP28676 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCAP28676 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCAP28676 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCAP28676 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCAP28676 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GCAP28676 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCAP28676 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCAP28676 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCAP28676 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCAP28676 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCAP28676 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GCAP28676 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCAP28676 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCAP28676 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCAP28676 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCAP28676 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCAP28676 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GCAP28676 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GCAP28676 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GCAP28676 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GCAP28676 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GCAP28676 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GCAP28676 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GCAP28676 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GCAP28676 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCAP28676 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCAP28676 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCAP28676 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCAP28676 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCAP28676 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCAP28676 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GCAP28676 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCAP28676 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCAP28676 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCAP28676 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCAP28676 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCAP28676 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCAP28676 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCAP28676 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCAP28676 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCAP28676 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCAP28676 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GCAP28676 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCAP28676 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCAP28676 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCAP28676 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCAP28676 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCAP28676 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCAP28676 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCAP28676 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCAP28676 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCAP28676 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCAP28676 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCAP28676 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCAP28676 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GCAP28676 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCAP28676 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GCAP28676 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCAP28676 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GCAP28676 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GCAP28676 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCAP28676 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GCAP28676 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCAP28676 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCAP28676 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GCAP28676 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GCAP28676 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GCAP28676 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GCAP28676 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GCAP28676 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCAP28676 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GCAP28676 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GCAP28676 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms