Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms