Protein–RNA interactions for Protein: P27352

GIF, Gastric intrinsic factor, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIFP27352 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIFP27352 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIFP27352 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIFP27352 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIFP27352 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIFP27352 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIFP27352 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIFP27352 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIFP27352 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIFP27352 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIFP27352 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIFP27352 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIFP27352 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIFP27352 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIFP27352 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GIFP27352 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIFP27352 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIFP27352 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIFP27352 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIFP27352 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIFP27352 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIFP27352 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIFP27352 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIFP27352 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIFP27352 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIFP27352 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIFP27352 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIFP27352 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIFP27352 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIFP27352 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIFP27352 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIFP27352 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIFP27352 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIFP27352 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIFP27352 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIFP27352 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIFP27352 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIFP27352 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIFP27352 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIFP27352 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIFP27352 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIFP27352 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIFP27352 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIFP27352 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIFP27352 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIFP27352 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIFP27352 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIFP27352 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIFP27352 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIFP27352 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIFP27352 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GIFP27352 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GIFP27352 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GIFP27352 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIFP27352 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIFP27352 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIFP27352 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIFP27352 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIFP27352 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIFP27352 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIFP27352 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIFP27352 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIFP27352 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIFP27352 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIFP27352 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIFP27352 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIFP27352 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIFP27352 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIFP27352 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIFP27352 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIFP27352 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIFP27352 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIFP27352 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIFP27352 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIFP27352 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GIFP27352 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GIFP27352 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GIFP27352 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GIFP27352 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GIFP27352 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GIFP27352 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GIFP27352 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GIFP27352 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GIFP27352 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GIFP27352 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GIFP27352 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIFP27352 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIFP27352 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIFP27352 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIFP27352 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIFP27352 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIFP27352 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIFP27352 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIFP27352 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIFP27352 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIFP27352 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIFP27352 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIFP27352 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GIFP27352 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIFP27352 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms