Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms