Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA1P21709 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms