Protein–RNA interactions for Protein: P20936

RASA1, Ras GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASA1P20936 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RASA1P20936 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RASA1P20936 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RASA1P20936 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RASA1P20936 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RASA1P20936 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RASA1P20936 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RASA1P20936 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RASA1P20936 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
RASA1P20936 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RASA1P20936 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RASA1P20936 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RASA1P20936 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RASA1P20936 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RASA1P20936 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RASA1P20936 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RASA1P20936 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RASA1P20936 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RASA1P20936 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RASA1P20936 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RASA1P20936 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RASA1P20936 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RASA1P20936 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RASA1P20936 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RASA1P20936 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RASA1P20936 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RASA1P20936 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
RASA1P20936 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RASA1P20936 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RASA1P20936 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RASA1P20936 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
RASA1P20936 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RASA1P20936 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RASA1P20936 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RASA1P20936 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RASA1P20936 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
RASA1P20936 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RASA1P20936 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RASA1P20936 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RASA1P20936 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RASA1P20936 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RASA1P20936 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RASA1P20936 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RASA1P20936 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
RASA1P20936 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RASA1P20936 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RASA1P20936 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RASA1P20936 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RASA1P20936 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RASA1P20936 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RASA1P20936 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RASA1P20936 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RASA1P20936 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RASA1P20936 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RASA1P20936 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RASA1P20936 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RASA1P20936 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RASA1P20936 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RASA1P20936 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RASA1P20936 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RASA1P20936 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RASA1P20936 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RASA1P20936 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RASA1P20936 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RASA1P20936 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RASA1P20936 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RASA1P20936 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RASA1P20936 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RASA1P20936 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RASA1P20936 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RASA1P20936 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RASA1P20936 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RASA1P20936 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC21■□□□□ 0.95
RASA1P20936 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RASA1P20936 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RASA1P20936 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RASA1P20936 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
RASA1P20936 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RASA1P20936 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RASA1P20936 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RASA1P20936 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RASA1P20936 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
RASA1P20936 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RASA1P20936 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RASA1P20936 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RASA1P20936 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RASA1P20936 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RASA1P20936 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RASA1P20936 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RASA1P20936 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RASA1P20936 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RASA1P20936 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RASA1P20936 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
RASA1P20936 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RASA1P20936 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RASA1P20936 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
RASA1P20936 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RASA1P20936 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RASA1P20936 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RASA1P20936 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms