Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
HLA-DPA1P20036 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
HLA-DPA1P20036 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DPA1P20036 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DPA1P20036 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DPA1P20036 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DPA1P20036 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DPA1P20036 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DPA1P20036 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DPA1P20036 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DPA1P20036 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DPA1P20036 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DPA1P20036 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DPA1P20036 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DPA1P20036 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DPA1P20036 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DPA1P20036 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DPA1P20036 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DPA1P20036 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DPA1P20036 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DPA1P20036 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DPA1P20036 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DPA1P20036 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DPA1P20036 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DPA1P20036 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DPA1P20036 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DPA1P20036 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DPA1P20036 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DPA1P20036 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DPA1P20036 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DPA1P20036 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DPA1P20036 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DPA1P20036 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DPA1P20036 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DPA1P20036 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DPA1P20036 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DPA1P20036 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DPA1P20036 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DPA1P20036 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DPA1P20036 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DPA1P20036 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DPA1P20036 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DPA1P20036 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-DPA1P20036 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-DPA1P20036 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-DPA1P20036 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-DPA1P20036 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-DPA1P20036 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-DPA1P20036 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-DPA1P20036 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-DPA1P20036 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-DPA1P20036 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-DPA1P20036 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-DPA1P20036 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-DPA1P20036 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-DPA1P20036 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-DPA1P20036 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-DPA1P20036 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-DPA1P20036 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms