Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms