Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD8P13378 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD8P13378 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD8P13378 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD8P13378 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD8P13378 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD8P13378 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD8P13378 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD8P13378 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD8P13378 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD8P13378 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD8P13378 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD8P13378 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD8P13378 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD8P13378 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD8P13378 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD8P13378 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD8P13378 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD8P13378 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD8P13378 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD8P13378 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD8P13378 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD8P13378 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD8P13378 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD8P13378 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD8P13378 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD8P13378 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD8P13378 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD8P13378 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD8P13378 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD8P13378 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD8P13378 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD8P13378 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD8P13378 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD8P13378 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD8P13378 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD8P13378 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD8P13378 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD8P13378 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD8P13378 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD8P13378 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD8P13378 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD8P13378 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD8P13378 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD8P13378 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD8P13378 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD8P13378 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD8P13378 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
HOXD8P13378 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
HOXD8P13378 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD8P13378 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD8P13378 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD8P13378 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD8P13378 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD8P13378 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD8P13378 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD8P13378 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD8P13378 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD8P13378 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD8P13378 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD8P13378 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD8P13378 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD8P13378 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD8P13378 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD8P13378 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD8P13378 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD8P13378 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD8P13378 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD8P13378 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD8P13378 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD8P13378 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD8P13378 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD8P13378 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD8P13378 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD8P13378 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD8P13378 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD8P13378 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD8P13378 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD8P13378 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD8P13378 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD8P13378 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD8P13378 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD8P13378 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD8P13378 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD8P13378 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD8P13378 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD8P13378 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD8P13378 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD8P13378 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD8P13378 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD8P13378 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD8P13378 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD8P13378 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD8P13378 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD8P13378 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD8P13378 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD8P13378 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD8P13378 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD8P13378 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD8P13378 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
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