Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms