Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RLBP1P12271 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms