Protein–RNA interactions for Protein: P12074

COX6A1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A1P12074 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COX6A1P12074 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms