Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ODC1P11926 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ODC1P11926 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ODC1P11926 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ODC1P11926 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ODC1P11926 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ODC1P11926 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ODC1P11926 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ODC1P11926 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ODC1P11926 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ODC1P11926 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ODC1P11926 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ODC1P11926 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ODC1P11926 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ODC1P11926 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ODC1P11926 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ODC1P11926 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ODC1P11926 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ODC1P11926 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ODC1P11926 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ODC1P11926 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ODC1P11926 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ODC1P11926 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ODC1P11926 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ODC1P11926 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ODC1P11926 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ODC1P11926 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ODC1P11926 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ODC1P11926 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ODC1P11926 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ODC1P11926 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ODC1P11926 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ODC1P11926 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ODC1P11926 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ODC1P11926 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ODC1P11926 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ODC1P11926 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ODC1P11926 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ODC1P11926 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ODC1P11926 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ODC1P11926 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ODC1P11926 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ODC1P11926 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ODC1P11926 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ODC1P11926 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ODC1P11926 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ODC1P11926 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ODC1P11926 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ODC1P11926 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ODC1P11926 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ODC1P11926 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ODC1P11926 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ODC1P11926 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ODC1P11926 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ODC1P11926 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ODC1P11926 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ODC1P11926 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ODC1P11926 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ODC1P11926 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ODC1P11926 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ODC1P11926 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ODC1P11926 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ODC1P11926 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ODC1P11926 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ODC1P11926 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ODC1P11926 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ODC1P11926 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ODC1P11926 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ODC1P11926 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ODC1P11926 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ODC1P11926 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ODC1P11926 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ODC1P11926 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ODC1P11926 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ODC1P11926 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ODC1P11926 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ODC1P11926 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ODC1P11926 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
ODC1P11926 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ODC1P11926 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ODC1P11926 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ODC1P11926 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ODC1P11926 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ODC1P11926 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ODC1P11926 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ODC1P11926 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ODC1P11926 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ODC1P11926 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ODC1P11926 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ODC1P11926 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ODC1P11926 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ODC1P11926 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ODC1P11926 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ODC1P11926 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ODC1P11926 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ODC1P11926 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ODC1P11926 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ODC1P11926 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ODC1P11926 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ODC1P11926 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms