Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GLI4P10075 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GLI4P10075 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GLI4P10075 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GLI4P10075 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GLI4P10075 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GLI4P10075 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GLI4P10075 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GLI4P10075 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GLI4P10075 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GLI4P10075 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GLI4P10075 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GLI4P10075 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GLI4P10075 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GLI4P10075 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GLI4P10075 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GLI4P10075 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GLI4P10075 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GLI4P10075 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GLI4P10075 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GLI4P10075 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GLI4P10075 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GLI4P10075 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GLI4P10075 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GLI4P10075 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GLI4P10075 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GLI4P10075 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GLI4P10075 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GLI4P10075 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GLI4P10075 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GLI4P10075 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GLI4P10075 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GLI4P10075 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GLI4P10075 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GLI4P10075 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GLI4P10075 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GLI4P10075 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GLI4P10075 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GLI4P10075 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GLI4P10075 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GLI4P10075 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GLI4P10075 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GLI4P10075 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GLI4P10075 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GLI4P10075 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GLI4P10075 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GLI4P10075 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GLI4P10075 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GLI4P10075 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GLI4P10075 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GLI4P10075 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GLI4P10075 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GLI4P10075 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GLI4P10075 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GLI4P10075 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GLI4P10075 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GLI4P10075 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GLI4P10075 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GLI4P10075 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GLI4P10075 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GLI4P10075 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GLI4P10075 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GLI4P10075 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GLI4P10075 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GLI4P10075 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GLI4P10075 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GLI4P10075 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GLI4P10075 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GLI4P10075 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GLI4P10075 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GLI4P10075 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GLI4P10075 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GLI4P10075 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI4P10075 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI4P10075 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI4P10075 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI4P10075 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI4P10075 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI4P10075 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI4P10075 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI4P10075 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI4P10075 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI4P10075 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI4P10075 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI4P10075 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI4P10075 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI4P10075 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI4P10075 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI4P10075 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI4P10075 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI4P10075 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI4P10075 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI4P10075 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI4P10075 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI4P10075 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI4P10075 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI4P10075 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI4P10075 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI4P10075 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GLI4P10075 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms