Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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PKHD1P08F94 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
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PKHD1P08F94 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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PKHD1P08F94 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
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PKHD1P08F94 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
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PKHD1P08F94 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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PKHD1P08F94 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
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