Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NGFRP08138 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NGFRP08138 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NGFRP08138 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NGFRP08138 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NGFRP08138 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NGFRP08138 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NGFRP08138 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NGFRP08138 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NGFRP08138 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NGFRP08138 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NGFRP08138 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NGFRP08138 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NGFRP08138 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NGFRP08138 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NGFRP08138 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NGFRP08138 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NGFRP08138 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NGFRP08138 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NGFRP08138 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NGFRP08138 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NGFRP08138 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NGFRP08138 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NGFRP08138 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NGFRP08138 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NGFRP08138 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NGFRP08138 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NGFRP08138 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NGFRP08138 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NGFRP08138 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NGFRP08138 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NGFRP08138 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NGFRP08138 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NGFRP08138 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NGFRP08138 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NGFRP08138 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NGFRP08138 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NGFRP08138 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NGFRP08138 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NGFRP08138 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NGFRP08138 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NGFRP08138 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NGFRP08138 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NGFRP08138 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NGFRP08138 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NGFRP08138 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NGFRP08138 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NGFRP08138 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NGFRP08138 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NGFRP08138 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NGFRP08138 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NGFRP08138 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NGFRP08138 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NGFRP08138 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NGFRP08138 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NGFRP08138 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NGFRP08138 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NGFRP08138 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NGFRP08138 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NGFRP08138 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NGFRP08138 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NGFRP08138 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NGFRP08138 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NGFRP08138 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NGFRP08138 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NGFRP08138 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NGFRP08138 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NGFRP08138 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NGFRP08138 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NGFRP08138 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NGFRP08138 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NGFRP08138 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NGFRP08138 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NGFRP08138 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NGFRP08138 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NGFRP08138 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NGFRP08138 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NGFRP08138 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NGFRP08138 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NGFRP08138 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NGFRP08138 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NGFRP08138 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NGFRP08138 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NGFRP08138 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NGFRP08138 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NGFRP08138 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NGFRP08138 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NGFRP08138 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NGFRP08138 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NGFRP08138 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NGFRP08138 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NGFRP08138 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NGFRP08138 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NGFRP08138 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NGFRP08138 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NGFRP08138 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NGFRP08138 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NGFRP08138 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NGFRP08138 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NGFRP08138 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms