Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms