Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSD2O96028 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSD2O96028 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSD2O96028 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSD2O96028 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSD2O96028 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSD2O96028 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSD2O96028 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSD2O96028 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSD2O96028 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSD2O96028 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSD2O96028 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSD2O96028 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSD2O96028 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NSD2O96028 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NSD2O96028 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NSD2O96028 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NSD2O96028 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NSD2O96028 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NSD2O96028 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NSD2O96028 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NSD2O96028 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NSD2O96028 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NSD2O96028 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NSD2O96028 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NSD2O96028 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NSD2O96028 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NSD2O96028 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NSD2O96028 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NSD2O96028 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NSD2O96028 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NSD2O96028 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NSD2O96028 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NSD2O96028 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NSD2O96028 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NSD2O96028 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NSD2O96028 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NSD2O96028 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NSD2O96028 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NSD2O96028 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NSD2O96028 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSD2O96028 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSD2O96028 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSD2O96028 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSD2O96028 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSD2O96028 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSD2O96028 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSD2O96028 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSD2O96028 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSD2O96028 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NSD2O96028 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSD2O96028 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSD2O96028 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSD2O96028 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSD2O96028 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSD2O96028 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSD2O96028 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSD2O96028 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSD2O96028 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSD2O96028 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NSD2O96028 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NSD2O96028 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NSD2O96028 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NSD2O96028 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NSD2O96028 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NSD2O96028 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NSD2O96028 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NSD2O96028 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NSD2O96028 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NSD2O96028 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NSD2O96028 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NSD2O96028 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NSD2O96028 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NSD2O96028 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NSD2O96028 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NSD2O96028 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NSD2O96028 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NSD2O96028 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NSD2O96028 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NSD2O96028 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NSD2O96028 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NSD2O96028 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NSD2O96028 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSD2O96028 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSD2O96028 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSD2O96028 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSD2O96028 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSD2O96028 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSD2O96028 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSD2O96028 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NSD2O96028 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSD2O96028 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSD2O96028 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSD2O96028 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSD2O96028 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSD2O96028 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSD2O96028 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NSD2O96028 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSD2O96028 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSD2O96028 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms