Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR1AO95602 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLR1AO95602 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms