Protein–RNA interactions for Protein: O94966

USP19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19O94966 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP19O94966 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP19O94966 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
USP19O94966 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP19O94966 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP19O94966 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP19O94966 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP19O94966 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP19O94966 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP19O94966 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP19O94966 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP19O94966 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP19O94966 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP19O94966 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP19O94966 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP19O94966 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP19O94966 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP19O94966 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP19O94966 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP19O94966 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP19O94966 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP19O94966 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP19O94966 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP19O94966 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
USP19O94966 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP19O94966 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP19O94966 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP19O94966 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP19O94966 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP19O94966 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP19O94966 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
USP19O94966 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC24.27■■□□□ 1.47
USP19O94966 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP19O94966 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP19O94966 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP19O94966 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP19O94966 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP19O94966 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP19O94966 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP19O94966 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP19O94966 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
USP19O94966 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP19O94966 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP19O94966 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP19O94966 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP19O94966 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP19O94966 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP19O94966 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP19O94966 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP19O94966 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP19O94966 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP19O94966 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP19O94966 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP19O94966 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP19O94966 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
USP19O94966 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP19O94966 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP19O94966 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP19O94966 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP19O94966 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
USP19O94966 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP19O94966 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
USP19O94966 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
USP19O94966 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP19O94966 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP19O94966 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP19O94966 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP19O94966 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
USP19O94966 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP19O94966 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP19O94966 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP19O94966 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP19O94966 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP19O94966 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP19O94966 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP19O94966 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP19O94966 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP19O94966 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP19O94966 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP19O94966 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP19O94966 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
USP19O94966 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP19O94966 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP19O94966 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP19O94966 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP19O94966 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP19O94966 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP19O94966 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP19O94966 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP19O94966 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP19O94966 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP19O94966 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP19O94966 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP19O94966 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP19O94966 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP19O94966 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP19O94966 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP19O94966 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP19O94966 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP19O94966 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms