Protein–RNA interactions for Protein: O60760

HPGDS, Hematopoietic prostaglandin D synthase, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDSO60760 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HPGDSO60760 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms