Protein–RNA interactions for Protein: O60759

CYTIP, Cytohesin-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTIPO60759 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTIPO60759 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms