Protein–RNA interactions for Protein: O60506

SYNCRIP, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCRIPO60506 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNCRIPO60506 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms