Protein–RNA interactions for Protein: O60308

CEP104, Centrosomal protein of 104 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP104O60308 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP104O60308 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP104O60308 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP104O60308 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP104O60308 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP104O60308 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP104O60308 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP104O60308 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP104O60308 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP104O60308 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP104O60308 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP104O60308 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP104O60308 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP104O60308 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP104O60308 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP104O60308 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP104O60308 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP104O60308 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP104O60308 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP104O60308 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP104O60308 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP104O60308 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP104O60308 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP104O60308 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP104O60308 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP104O60308 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CEP104O60308 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CEP104O60308 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CEP104O60308 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CEP104O60308 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CEP104O60308 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CEP104O60308 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CEP104O60308 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CEP104O60308 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CEP104O60308 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CEP104O60308 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CEP104O60308 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CEP104O60308 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CEP104O60308 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CEP104O60308 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CEP104O60308 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CEP104O60308 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CEP104O60308 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CEP104O60308 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CEP104O60308 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CEP104O60308 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CEP104O60308 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CEP104O60308 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CEP104O60308 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CEP104O60308 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CEP104O60308 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CEP104O60308 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CEP104O60308 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CEP104O60308 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CEP104O60308 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CEP104O60308 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CEP104O60308 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CEP104O60308 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CEP104O60308 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CEP104O60308 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP104O60308 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP104O60308 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP104O60308 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP104O60308 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP104O60308 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP104O60308 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP104O60308 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP104O60308 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP104O60308 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP104O60308 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP104O60308 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP104O60308 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP104O60308 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP104O60308 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP104O60308 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP104O60308 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP104O60308 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP104O60308 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP104O60308 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP104O60308 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP104O60308 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP104O60308 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP104O60308 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP104O60308 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP104O60308 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP104O60308 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP104O60308 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP104O60308 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP104O60308 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP104O60308 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP104O60308 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP104O60308 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP104O60308 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP104O60308 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP104O60308 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP104O60308 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP104O60308 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP104O60308 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP104O60308 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP104O60308 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms