Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms