Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms