Protein–RNA interactions for Protein: O43567

RNF13, E3 ubiquitin-protein ligase RNF13, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF13O43567 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF13O43567 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF13O43567 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF13O43567 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF13O43567 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF13O43567 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF13O43567 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF13O43567 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF13O43567 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF13O43567 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF13O43567 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF13O43567 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF13O43567 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF13O43567 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF13O43567 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF13O43567 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF13O43567 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF13O43567 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF13O43567 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF13O43567 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF13O43567 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF13O43567 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF13O43567 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF13O43567 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF13O43567 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF13O43567 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF13O43567 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF13O43567 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF13O43567 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF13O43567 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF13O43567 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF13O43567 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF13O43567 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF13O43567 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF13O43567 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF13O43567 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF13O43567 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF13O43567 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF13O43567 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF13O43567 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF13O43567 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF13O43567 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF13O43567 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF13O43567 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF13O43567 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF13O43567 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF13O43567 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF13O43567 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF13O43567 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF13O43567 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF13O43567 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF13O43567 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF13O43567 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF13O43567 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF13O43567 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF13O43567 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF13O43567 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF13O43567 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF13O43567 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF13O43567 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF13O43567 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF13O43567 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF13O43567 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF13O43567 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF13O43567 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF13O43567 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF13O43567 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF13O43567 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF13O43567 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF13O43567 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF13O43567 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF13O43567 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF13O43567 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF13O43567 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF13O43567 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF13O43567 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF13O43567 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF13O43567 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF13O43567 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF13O43567 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF13O43567 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF13O43567 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF13O43567 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF13O43567 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF13O43567 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF13O43567 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF13O43567 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF13O43567 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF13O43567 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF13O43567 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF13O43567 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF13O43567 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF13O43567 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF13O43567 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF13O43567 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF13O43567 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF13O43567 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF13O43567 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF13O43567 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF13O43567 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms