Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms