Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTDSP2O14595 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTDSP2O14595 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms