Protein–RNA interactions for Protein: O00591

GABRP, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit pi, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRPO00591 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRPO00591 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRPO00591 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRPO00591 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GABRPO00591 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRPO00591 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRPO00591 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRPO00591 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRPO00591 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRPO00591 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRPO00591 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRPO00591 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRPO00591 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRPO00591 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRPO00591 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRPO00591 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRPO00591 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRPO00591 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRPO00591 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRPO00591 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRPO00591 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRPO00591 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRPO00591 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRPO00591 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRPO00591 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRPO00591 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRPO00591 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRPO00591 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRPO00591 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRPO00591 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRPO00591 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRPO00591 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRPO00591 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRPO00591 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRPO00591 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRPO00591 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRPO00591 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRPO00591 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRPO00591 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRPO00591 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRPO00591 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRPO00591 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRPO00591 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRPO00591 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRPO00591 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRPO00591 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRPO00591 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRPO00591 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRPO00591 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRPO00591 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRPO00591 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRPO00591 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRPO00591 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRPO00591 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRPO00591 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRPO00591 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRPO00591 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRPO00591 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRPO00591 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRPO00591 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRPO00591 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRPO00591 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRPO00591 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRPO00591 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRPO00591 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRPO00591 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRPO00591 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRPO00591 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRPO00591 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRPO00591 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRPO00591 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRPO00591 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRPO00591 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRPO00591 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRPO00591 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRPO00591 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRPO00591 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRPO00591 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRPO00591 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRPO00591 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRPO00591 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRPO00591 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRPO00591 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRPO00591 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRPO00591 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRPO00591 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRPO00591 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRPO00591 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRPO00591 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRPO00591 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRPO00591 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRPO00591 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRPO00591 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRPO00591 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRPO00591 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRPO00591 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRPO00591 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRPO00591 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRPO00591 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRPO00591 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms