Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms