Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPBD1B2RD01 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms