Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

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Length 253 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ODF3BA8MYP8 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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