Protein–RNA interactions for Protein: A8MTJ6

FOXI3, Forkhead box protein I3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXI3A8MTJ6 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXI3A8MTJ6 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms