Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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