Protein–RNA interactions for Protein: A6NKL6

TMEM200C, Transmembrane protein 200C, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200CA6NKL6 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms