Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC69A6NI79 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC69A6NI79 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC69A6NI79 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC69A6NI79 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC69A6NI79 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC69A6NI79 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC69A6NI79 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC69A6NI79 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC69A6NI79 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC69A6NI79 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC69A6NI79 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC69A6NI79 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC69A6NI79 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC69A6NI79 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms