Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms