Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
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