Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K6

CD2AP, CD2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD2APQ9Y5K6 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD2APQ9Y5K6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms